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宝安区慢性病防治院成立于1987年，起源于宝安县慢性病防治站，原址位于宝安区36区（宝安公园旁），2003年4月更为现名，2012年10月整体搬迁至宝安区西乡街道文卫路99号（平峦山公园），2018年9月实行防保、临床业务分离、人员分流改革，2019年7月搬迁至宝安区裕安二路332号运营办公。2015年经区编办批准加挂宝安区精神卫生中心，2023年6月加挂宝安区老年健康指导中心，目前为三块牌子一套人马，行政管理岗位为七级，财政全额保障。为公益性公共卫生服务机构。

目前内设12个科室，分别为：办公室、计财科、总务设备科、业务管理科（基本公共卫生项目办）、结核病防制科、性病麻风病防制科、健康管理科、慢性病综合防制科、精神卫生科、实验室、信息科、健康有球手机版登录与促进科。慢性病防治为区级重点学科。为中山大学、暨南大学研究生实践培养基地，山西医科大学、中南大学、广东药科大学预防医学专业本科有球手机版登录实习基地。

2025年9月止，在岗工作人员94人，其中事业编制人员70人，聘用人员24人。卫生专业技术人员79人，其中高级职称19人，中级职称32人。博士研究生4人，硕士研究生47人。本科29人。

主要承担宝安区的慢性传染性疾病（结核病、性病、麻风病）、慢性非传染性疾病（高血压、糖尿病、恶性肿瘤、脑卒中、急性心肌梗死、伤害监测、慢阻肺）、健康档案管理、老年保健、精神卫生（社会心理服务指导、严重精神障碍患者监测与管理）、口腔卫生项目（免费窝沟封闭、儿童口腔疾病干预）和健康有球手机版登录与促进等职能和工作任务，负责居民健康档案管理、高血压、糖尿病、结核病、精神障碍、老年人管理、慢性阻塞性肺疾病患者管理7项有球手机版登录基本公共卫生服务项目的业务管理和技术指导工作。区慢病院一直作为有球手机版登录公共卫生改革（结核病防治重大科技专项、有球手机版登录慢性病综合防控示范区）的试验田和先行区，在慢性病控制和流动人口健康管理方面积累了丰富经验，成为深圳市公共卫生方面的一张亮丽名片。

宝安区慢性病防治院始终遵循“政府主导、多部门协作、专业机构支持、社会广泛参与”的原则，形成了以区慢病院为主导、区内综合有球手机版登录和区公共卫生服务各分中心为骨干、各社区健康服务中心为网底的“三位一体”慢性病防控机制，探索出一条“健康双工 慢病专业队伍”、“文化春雨行动捆绑”、“免费窝沟封闭进校园”、“健康有球手机版登录讲师团菜单式服务”等具有宝安特色、“预防-治疗-健康管理”一体化（简称“防治管一体化”）的慢性病防控工作模式，积极构建宝安区有球手机版登录慢性病综合防控示范区、有球手机版登录重大科技专项结核病综合防治示范区、有球手机版登录精神卫生综合管理和社会心理服务试点区的战略发展格局，受到侯云德、李兰娟等院士的好评，为辖区市民的身心健康保驾护航。